Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pkd2l1A2A259 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pkd2l1A2A259 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms