Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam71e1A1L3C1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam71e1A1L3C1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms