Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
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Trbv21A0A0A6YX06 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trbv21A0A0A6YX06 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv21A0A0A6YX06 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv21A0A0A6YX06 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv21A0A0A6YX06 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv21A0A0A6YX06 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv21A0A0A6YX06 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv21A0A0A6YX06 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv21A0A0A6YX06 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv21A0A0A6YX06 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Trbv21A0A0A6YX06 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trbv21A0A0A6YX06 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Trbv21A0A0A6YX06 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Trbv21A0A0A6YX06 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Trbv21A0A0A6YX06 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Trbv21A0A0A6YX06 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Trbv21A0A0A6YX06 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Trbv21A0A0A6YX06 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Trbv21A0A0A6YX06 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trbv21A0A0A6YX06 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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