Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Psmb11-201ENSMUST00000097177 4247 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 6330549D23Rik-203ENSMUST00000160818 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Steap4-201ENSMUST00000115421 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Mlip-210ENSMUST00000184322 2668 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Nol12-203ENSMUST00000138880 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm45718-201ENSMUST00000207577 3794 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm42444-201ENSMUST00000199366 4558 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Vmn2r114-201ENSMUST00000168033 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gpr83-202ENSMUST00000115624 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Slco2b1-203ENSMUST00000107088 4369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm3147-202ENSMUST00000201071 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 A430089I19Rik-201ENSMUST00000097479 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Tmem63c-201ENSMUST00000110187 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 CT025642.3-201ENSMUST00000225503 4086 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Sox5-205ENSMUST00000111749 3879 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Osmr-204ENSMUST00000176826 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Nme8-201ENSMUST00000039340 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Mamdc4-201ENSMUST00000095117 3990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 A430033K04Rik-202ENSMUST00000069862 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Fam90a1a-201ENSMUST00000110741 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Lingo2-204ENSMUST00000108124 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Synj2-208ENSMUST00000115789 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Ccdc18Q640L5 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Patj-202ENSMUST00000041284 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm5316-202ENSMUST00000185734 3096 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Fam217a-201ENSMUST00000021851 2402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Asb17-201ENSMUST00000044089 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Acbd5-202ENSMUST00000114523 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Dclk1-212ENSMUST00000199585 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Trpc7-202ENSMUST00000109871 3519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc18Q640L5 Tmem268-202ENSMUST00000080336 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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