Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Selenok-ps7-201ENSMUST00000197069 283 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Muc13-202ENSMUST00000115044 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gpatch2-206ENSMUST00000160471 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Zfat-202ENSMUST00000160248 3866 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Paqr7-202ENSMUST00000095074 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm42897-201ENSMUST00000201486 2112 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Tdrd3-205ENSMUST00000170865 2530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm12265-201ENSMUST00000139025 468 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 AC165254.1-203ENSMUST00000222925 574 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 AC125405.2-201ENSMUST00000227862 383 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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AtmQ62388 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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AtmQ62388 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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AtmQ62388 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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AtmQ62388 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm42811-201ENSMUST00000201951 2768 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Pes1-202ENSMUST00000109985 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Fam90a1a-201ENSMUST00000110741 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm11548-201ENSMUST00000140203 2199 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Gm13548-201ENSMUST00000144688 385 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
AtmQ62388 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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