Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm14267-205ENSMUST00000226697 1299 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Rnf219-204ENSMUST00000228448 1056 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Tsr2-201ENSMUST00000026295 3804 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Cutal-202ENSMUST00000047447 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Ces1b-201ENSMUST00000109582 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Pnmal1-201ENSMUST00000038163 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Lrrc55-202ENSMUST00000111601 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Neu3-201ENSMUST00000036331 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Calr3-202ENSMUST00000109974 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Gm29427-201ENSMUST00000188520 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Ciart-201ENSMUST00000036418 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Phc1-201ENSMUST00000079560 3839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Upf2-201ENSMUST00000060092 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Slc30a2-202ENSMUST00000105872 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Gm15128-201ENSMUST00000112814 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 AC100729.1-201ENSMUST00000225458 1454 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Tango6-201ENSMUST00000048359 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Rhoh-202ENSMUST00000201533 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Bmf-202ENSMUST00000110859 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Jarid2-210ENSMUST00000173704 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Slc9a8-203ENSMUST00000109218 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Scgb1b7-201ENSMUST00000108097 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Gm11109-201ENSMUST00000180289 384 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Gm17813-201ENSMUST00000185377 328 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Ighv5-18-201ENSMUST00000193834 326 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm43957-201ENSMUST00000203606 362 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm46391-201ENSMUST00000220704 203 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 4930448C13Rik-205ENSMUST00000221781 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC126939.2-201ENSMUST00000225989 307 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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