Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm16541-201ENSMUST00000160992 614 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
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Sh3bp1P55194 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Sh3bp1P55194 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms