Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Olfr380-201ENSMUST00000075532 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Proz-201ENSMUST00000033822 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Rbx1-201ENSMUST00000023036 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm9866-206ENSMUST00000222838 1580 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
RxraP28700 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Tpi-rs8-201ENSMUST00000120382 708 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm12517-201ENSMUST00000122082 425 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm12930-201ENSMUST00000146679 676 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm26070-201ENSMUST00000157500 137 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 D7Ertd128e-201ENSMUST00000189744 928 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 A130023I24Rik-201ENSMUST00000152709 1897 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Ift46-202ENSMUST00000118186 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
RxraP28700 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
RxraP28700 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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