Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Pkd2l2-201ENSMUST00000014647 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Smco3-203ENSMUST00000203468 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Olfr1510-202ENSMUST00000215928 1934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Hfe-202ENSMUST00000091706 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm18973-201ENSMUST00000205814 511 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 AC114585.2-203ENSMUST00000228400 339 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm16050-201ENSMUST00000160626 2363 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
NefhP19246 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Dnajc28-204ENSMUST00000169982 3535 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm16223-201ENSMUST00000087332 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Cblb-205ENSMUST00000227756 3378 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm6558-202ENSMUST00000192046 180 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Plut-203ENSMUST00000201192 569 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Guca2a-201ENSMUST00000024015 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Olfr530-201ENSMUST00000074177 1080 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Sla-205ENSMUST00000168589 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm15999-201ENSMUST00000127317 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 D7Bwg0826e-201ENSMUST00000208484 3795 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
NefhP19246 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Zfp750-201ENSMUST00000092298 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Ripor2-203ENSMUST00000091694 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Baalc-201ENSMUST00000163313 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Oat-201ENSMUST00000084500 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Pilrb2-201ENSMUST00000164886 1807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm29628-201ENSMUST00000187206 1500 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
NefhP19246 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms