Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm27509-201ENSMUST00000102400 79 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Inca1-204ENSMUST00000108543 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Cd59b-203ENSMUST00000111131 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm15464-201ENSMUST00000118718 431 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm10224-201ENSMUST00000119496 615 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm15627-201ENSMUST00000140421 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm25767-201ENSMUST00000158572 124 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm23823-201ENSMUST00000158740 124 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm17139-201ENSMUST00000163802 571 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm24325-201ENSMUST00000175344 74 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm18828-201ENSMUST00000180475 857 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm28723-201ENSMUST00000188640 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm29485-201ENSMUST00000190220 282 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm42628-201ENSMUST00000198498 764 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm18485-201ENSMUST00000203788 1114 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm45901-201ENSMUST00000203807 661 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC131100.1-201ENSMUST00000226328 470 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Mrps36-ps1-201ENSMUST00000061311 306 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm20501-202ENSMUST00000211303 2194 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TtrP07309 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Olfr608-201ENSMUST00000213546 1482 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm37886-201ENSMUST00000195349 1513 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm25594-201ENSMUST00000102274 82 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Hmgn2-202ENSMUST00000102552 676 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Pcna-ps1-201ENSMUST00000118453 738 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm5400-201ENSMUST00000118494 943 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm9392-201ENSMUST00000119337 554 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm13358-201ENSMUST00000121427 569 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Olfr1381-201ENSMUST00000167248 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Zfp422-ps-201ENSMUST00000182230 706 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm43782-201ENSMUST00000202790 229 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Olfr977-ps1-201ENSMUST00000217438 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC159293.1-201ENSMUST00000222662 545 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 AC139758.2-201ENSMUST00000228380 529 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Olfr770-201ENSMUST00000062314 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Snora74a-201ENSMUST00000083715 196 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
TtrP07309 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms