Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC125223.1-201ENSMUST00000224004 749 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gstm5-201ENSMUST00000004134 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Txndc16-204ENSMUST00000128484 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm36952-201ENSMUST00000194923 3625 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Cyp2d12-201ENSMUST00000068861 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm14332-201ENSMUST00000121982 899 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Kcnd3os-202ENSMUST00000143893 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm43837-201ENSMUST00000200306 668 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm43461-201ENSMUST00000202351 996 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Tssk4-203ENSMUST00000226497 1235 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 n-R5s74-201ENSMUST00000082654 116 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 1110008L16Rik-202ENSMUST00000183475 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Atg4a-201ENSMUST00000112971 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnft1Q9DCN7 Fam166b-202ENSMUST00000107928 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.9 ms