Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Fgd3-201ENSMUST00000048716 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Sox5-204ENSMUST00000111748 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm24327-201ENSMUST00000175108 78 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Cgnl1-201ENSMUST00000072899 6754 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Arap1-203ENSMUST00000098243 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Ces1e-201ENSMUST00000034173 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Ppip5k1-203ENSMUST00000110626 5171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Ppp4r1l-ps-205ENSMUST00000141051 4466 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Sez6l2-202ENSMUST00000106333 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Kcnj10-201ENSMUST00000056136 5407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm44284-201ENSMUST00000203836 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm43012-201ENSMUST00000198569 937 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm11868-201ENSMUST00000121594 1478 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Mark3-206ENSMUST00000221459 2807 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Tvp23a-201ENSMUST00000051118 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Sytl4-201ENSMUST00000033608 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Rnasel-201ENSMUST00000086209 2938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Slc2a9-205ENSMUST00000129099 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gprasp2-211ENSMUST00000173804 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm16130-201ENSMUST00000153106 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Apol11b-201ENSMUST00000166623 2057 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Lhx6-204ENSMUST00000112966 3188 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm43544-201ENSMUST00000196474 2472 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Btbd11-202ENSMUST00000105306 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Foxp3-203ENSMUST00000115739 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PtprtQ99M80 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms