Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm38839-201ENSMUST00000203833 633 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm34358-201ENSMUST00000204585 665 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 6430531B16Rik-205ENSMUST00000210254 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr271-ps1-202ENSMUST00000217546 852 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Lyg1-201ENSMUST00000027254 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC151903.1-201ENSMUST00000226677 1423 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm45718-201ENSMUST00000207577 3794 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Eef1g-201ENSMUST00000052248 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm10384-201ENSMUST00000100713 2046 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Zfp185-203ENSMUST00000164800 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Exoc1-203ENSMUST00000113493 3371 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm16485-201ENSMUST00000104915 3983 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Chid1-201ENSMUST00000026586 3964 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Gm38379-201ENSMUST00000194351 1525 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 2810455O05Rik-201ENSMUST00000138442 1691 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Plekhb2-203ENSMUST00000156687 5176 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Eny2-201ENSMUST00000060652 3000 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC120425.1-201ENSMUST00000225213 2360 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Hdac9-203ENSMUST00000209667 1635 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 1110019D14Rik-202ENSMUST00000181225 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm32255-201ENSMUST00000219456 1349 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Slamf9-201ENSMUST00000027830 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm10364-201ENSMUST00000076633 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Ccdc38-201ENSMUST00000092215 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Hp1bp3-214ENSMUST00000165861 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Tbxas1-206ENSMUST00000162521 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 Gm21188-201ENSMUST00000178618 573 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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Znf48Q3US17 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm29527-201ENSMUST00000190722 622 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm38258-201ENSMUST00000191792 675 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Ociad1-204ENSMUST00000200935 1139 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm42557-201ENSMUST00000202037 582 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm44331-201ENSMUST00000203217 388 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm36431-202ENSMUST00000209956 687 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm18873-201ENSMUST00000219517 1045 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Znf48Q3US17 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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