Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Erc1-201ENSMUST00000032279 8356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Pramef12-201ENSMUST00000030326 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Zfp407-202ENSMUST00000125763 7906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Zfp946-201ENSMUST00000088763 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm28352-201ENSMUST00000186654 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm28866-201ENSMUST00000187298 2167 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm28878-201ENSMUST00000188272 2167 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm28246-201ENSMUST00000188308 2167 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Gfi1P70338 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm28346-201ENSMUST00000189021 2167 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Cyp2d12-201ENSMUST00000068861 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Olfr353-201ENSMUST00000100149 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm10600-201ENSMUST00000117202 2047 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Gfi1P70338 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms