Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm25232-201ENSMUST00000104502 132 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm11621-201ENSMUST00000118253 589 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm8767-201ENSMUST00000215786 1070 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
SrprbP47758 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
SrprbP47758 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms