Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm37702-201ENSMUST00000194357 1872 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cep112-206ENSMUST00000130515 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm11756-201ENSMUST00000107310 1312 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm15704-201ENSMUST00000144757 2818 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC100590.1-201ENSMUST00000220318 1357 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm45817-201ENSMUST00000212738 1757 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Hdhd2-208ENSMUST00000148955 3069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr1198-202ENSMUST00000215179 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC132467.1-201ENSMUST00000226498 1845 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Tnfrsf10b-201ENSMUST00000022663 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Mettl15-201ENSMUST00000081631 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 1110008L16Rik-202ENSMUST00000183475 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Ighv14-2-201ENSMUST00000103467 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm13198-201ENSMUST00000119322 826 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm5398-201ENSMUST00000121933 984 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 n-R5s43-201ENSMUST00000122739 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm11739-201ENSMUST00000125269 723 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm13999-201ENSMUST00000141511 969 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm15179-202ENSMUST00000152799 671 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm25551-201ENSMUST00000158082 103 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Elf5-207ENSMUST00000171693 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Uchl1os-202ENSMUST00000177319 505 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm8266-201ENSMUST00000179745 1192 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm7132-201ENSMUST00000182302 984 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm20936-201ENSMUST00000191049 658 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm37822-201ENSMUST00000192618 1109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr1396-203ENSMUST00000203007 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 1700012B07Rik-201ENSMUST00000020941 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC134254.3-201ENSMUST00000223533 575 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC154598.2-201ENSMUST00000227114 604 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cldn10-201ENSMUST00000047761 1148 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr543-201ENSMUST00000061482 1130 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Olfr237-ps1-202ENSMUST00000215911 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Vpreb2P13373 Gm9165-201ENSMUST00000208467 2044 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms