Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm37066-201ENSMUST00000192713 2061 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Mapk6-202ENSMUST00000168937 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Mkrn2-201ENSMUST00000000449 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Asb17-201ENSMUST00000044089 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm18697-201ENSMUST00000191179 2126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Slc13a1-201ENSMUST00000031713 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC153940.1-201ENSMUST00000220149 5300 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Atg3Q9CPX6 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Atg3Q9CPX6 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Zfp207-208ENSMUST00000188489 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Olfr1395-202ENSMUST00000203377 2883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm37978-201ENSMUST00000194736 2915 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Wls-201ENSMUST00000068952 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm13240-201ENSMUST00000120042 565 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm6558-202ENSMUST00000192046 180 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Lpar2-201ENSMUST00000034325 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Exoc1-203ENSMUST00000113493 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 CT030170.4-201ENSMUST00000221539 1538 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Gm17821-201ENSMUST00000223448 1693 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atg3Q9CPX6 Mroh4-202ENSMUST00000137963 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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