Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Mir8110-201ENSMUST00000183771 97 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Trav22-201ENSMUST00000198117 346 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm39164-202ENSMUST00000211519 236 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 CT030709.1-201ENSMUST00000214443 443 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 AC153937.3-201ENSMUST00000217814 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 AC155644.1-201ENSMUST00000218527 890 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 C230072F16Rik-201ENSMUST00000219184 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 AC159649.1-201ENSMUST00000220851 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ghrh-201ENSMUST00000029172 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Svs3b-201ENSMUST00000063132 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Tac1-201ENSMUST00000090679 980 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm43041-201ENSMUST00000200022 2630 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Slc14a1-202ENSMUST00000160292 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Asph-206ENSMUST00000103004 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Wdr5b-201ENSMUST00000042203 1784 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm35572-201ENSMUST00000212427 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Zbtb44-206ENSMUST00000217092 2472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Pygl-202ENSMUST00000161083 2992 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Ralgps2-201ENSMUST00000027886 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 2610008E11Rik-201ENSMUST00000039271 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Palmd-201ENSMUST00000040097 2433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Ttc17-204ENSMUST00000111238 4590 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Fn3k-203ENSMUST00000103014 3841 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Mettl8-205ENSMUST00000121586 1151 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm14089-201ENSMUST00000130025 318 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm17359-201ENSMUST00000164216 778 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm8596-201ENSMUST00000188004 792 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm28361-201ENSMUST00000188825 474 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm43394-201ENSMUST00000198671 694 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 AC121821.1-201ENSMUST00000199921 111 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 1700012B07Rik-201ENSMUST00000020941 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm45323-201ENSMUST00000209853 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 CT030238.2-201ENSMUST00000227382 1278 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 8030411F24Rik-201ENSMUST00000028933 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Trps1-205ENSMUST00000183997 3627 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Osgepl1-202ENSMUST00000114484 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Psmb11-201ENSMUST00000097177 4247 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Txndc16-201ENSMUST00000022377 4028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Cecr2-201ENSMUST00000100993 4849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Cd22-203ENSMUST00000186154 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Adam9-201ENSMUST00000084032 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gys2-201ENSMUST00000032371 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm15169-202ENSMUST00000130794 2335 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Rnf214-209ENSMUST00000161203 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Gm35934-201ENSMUST00000213002 2494 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 4930534H03Rik-201ENSMUST00000216311 1669 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Clcn1Q64347 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms