Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Aplnr-201ENSMUST00000057019 3699 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Pcyt1a-201ENSMUST00000079791 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Luzp4-202ENSMUST00000163338 2025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm43776-201ENSMUST00000199729 2914 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Pygl-202ENSMUST00000161083 2992 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Epn2-201ENSMUST00000001063 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Ube2k-207ENSMUST00000202082 4506 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Btn2a2-203ENSMUST00000110433 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nphp4P59240 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms