Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 BC060293-201ENSMUST00000207005 1104 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC142407.1-201ENSMUST00000214371 494 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 9530020I12Rik-202ENSMUST00000218368 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm8623-201ENSMUST00000071573 436 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Tas2r138-201ENSMUST00000076565 996 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Mageb2-202ENSMUST00000201779 1551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Cep19-201ENSMUST00000042869 1567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Asic5-202ENSMUST00000107736 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
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Sh3bp1P55194 Gm15694-201ENSMUST00000121984 283 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm14813-201ENSMUST00000122291 395 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm12708-202ENSMUST00000136941 1046 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm17158-201ENSMUST00000168150 493 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Sdhd-201ENSMUST00000000175 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm27353-201ENSMUST00000184712 122 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm42529-201ENSMUST00000201843 741 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm45436-201ENSMUST00000210729 469 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm9305-201ENSMUST00000220962 599 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
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Sh3bp1P55194 Psors1c2-201ENSMUST00000025273 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Rnf125-201ENSMUST00000050004 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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Sh3bp1P55194 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm37065-203ENSMUST00000192498 1622 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
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Sh3bp1P55194 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
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Sh3bp1P55194 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
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Sh3bp1P55194 Ccser2-209ENSMUST00000183038 1681 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC161117.1-201ENSMUST00000221366 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
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Sh3bp1P55194 Spred1-202ENSMUST00000110901 1440 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm25594-201ENSMUST00000102274 82 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Igkv12-89-201ENSMUST00000103335 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm11440-201ENSMUST00000121509 527 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm12223-201ENSMUST00000135468 528 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 BC021767-202ENSMUST00000136988 905 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm24838-201ENSMUST00000158684 130 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 U2af1l4-205ENSMUST00000163482 668 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm20936-201ENSMUST00000191049 658 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm2788-205ENSMUST00000209849 933 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 5830408C22Rik-204ENSMUST00000211653 351 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
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