Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm18973-201ENSMUST00000205814 511 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 AC157570.2-201ENSMUST00000219091 700 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 AC142227.1-201ENSMUST00000221371 621 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 AC131100.1-201ENSMUST00000226328 470 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Skap1-201ENSMUST00000071510 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 n-R5s51-201ENSMUST00000104473 123 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 1700015F17Rik-201ENSMUST00000115447 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm12133-201ENSMUST00000121775 661 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm11827-201ENSMUST00000142297 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm16238-201ENSMUST00000159343 586 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Rasgef1b-207ENSMUST00000166484 1296 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 1700009J07Rik-201ENSMUST00000178996 912 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm6669-201ENSMUST00000179088 997 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm17828-201ENSMUST00000183380 799 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm28723-201ENSMUST00000188640 1001 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm19810-201ENSMUST00000218521 251 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm18114-201ENSMUST00000221780 523 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 4930473H19Rik-202ENSMUST00000222124 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Ucma-201ENSMUST00000027978 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Mrps36-ps1-201ENSMUST00000061311 306 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Olfr770-201ENSMUST00000062314 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm21957-201ENSMUST00000073056 438 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm15433-201ENSMUST00000097671 891 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
VhlP40338 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VhlP40338 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VhlP40338 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VhlP40338 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VhlP40338 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VhlP40338 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VhlP40338 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VhlP40338 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VhlP40338 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VhlP40338 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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