Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm10155-201ENSMUST00000084598 483 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Mical2-201ENSMUST00000037991 3352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
RxraP28700 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Bdnf-211ENSMUST00000176893 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Abca4-201ENSMUST00000013995 7263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 1700015F17Rik-201ENSMUST00000115447 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm9670-201ENSMUST00000121201 540 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm44156-201ENSMUST00000203885 1189 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm44725-201ENSMUST00000205307 391 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Lcn11-201ENSMUST00000091278 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
RxraP28700 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Ctdspl2-203ENSMUST00000110574 1616 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Scfd1-205ENSMUST00000219434 2749 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 3110099E03Rik-203ENSMUST00000143695 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Ighv1-9-201ENSMUST00000103498 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm7132-201ENSMUST00000182302 984 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
RxraP28700 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms