Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Cd99l2-201ENSMUST00000037391 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 AC121942.3-201ENSMUST00000225768 1436 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Gm38110-201ENSMUST00000194594 1551 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
P20040 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm29025-201ENSMUST00000186756 2163 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Btbd16-201ENSMUST00000048453 3434 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm36251-201ENSMUST00000213712 1914 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm13682-201ENSMUST00000117524 702 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm10651-201ENSMUST00000118212 609 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Olfr1381-201ENSMUST00000167248 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm18779-201ENSMUST00000173444 577 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 AC110236.1-201ENSMUST00000227807 527 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Olfr412-201ENSMUST00000077794 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Olfr152-203ENSMUST00000215394 2172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Fbxo3-203ENSMUST00000111135 3740 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm9105-201ENSMUST00000120160 1398 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Serpina1a-202ENSMUST00000085056 1360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Dctn5-201ENSMUST00000033156 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
P20040 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Gm27166-201ENSMUST00000184476 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 1600012P17Rik-201ENSMUST00000062159 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Tnfrsf10b-201ENSMUST00000022663 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Raet1d-202ENSMUST00000182677 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
P20040 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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