Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC166574.2-201ENSMUST00000226751 381 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC154227.2-201ENSMUST00000228677 2101 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 8030411F24Rik-201ENSMUST00000028933 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 5330417H12Rik-201ENSMUST00000060348 1191 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cxcl2-201ENSMUST00000075433 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mir25-201ENSMUST00000083460 84 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 n-R5s33-201ENSMUST00000093713 119 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 4930466I24Rik-201ENSMUST00000144105 2264 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 4930408K08Rik-201ENSMUST00000195936 1436 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm43942-201ENSMUST00000204522 2859 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm43420-201ENSMUST00000198012 1857 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 1110019D14Rik-202ENSMUST00000181225 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm40603-202ENSMUST00000219975 1642 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ddx47-201ENSMUST00000032326 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Zscan22-202ENSMUST00000117189 2995 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tmem209-203ENSMUST00000115157 2273 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm15470-201ENSMUST00000119135 1371 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 2310005A03Rik-201ENSMUST00000142569 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Sav1-201ENSMUST00000021467 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Pla2g2d-202ENSMUST00000105806 1206 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AY761185-201ENSMUST00000110758 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm7609-202ENSMUST00000113407 853 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm14648-201ENSMUST00000119328 483 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm9516-201ENSMUST00000119684 424 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm13655-201ENSMUST00000119695 745 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Rpl21-ps15-201ENSMUST00000121545 483 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm15742-201ENSMUST00000123905 659 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Snhg12-201ENSMUST00000126380 890 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm15942-201ENSMUST00000136305 810 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm13631-201ENSMUST00000140978 654 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm24838-201ENSMUST00000158684 130 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm23195-201ENSMUST00000158814 129 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm7609-203ENSMUST00000160058 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm2564-201ENSMUST00000166898 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Pax4-205ENSMUST00000174194 974 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm20686-201ENSMUST00000175846 535 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm17748-201ENSMUST00000177906 522 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm7083-201ENSMUST00000178617 450 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm29441-201ENSMUST00000191584 211 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1396-203ENSMUST00000203007 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm29725-201ENSMUST00000206614 407 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm18641-201ENSMUST00000211763 1246 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC120386.1-201ENSMUST00000213434 736 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ddo-205ENSMUST00000214102 792 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC140264.1-201ENSMUST00000220023 469 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm14267-205ENSMUST00000226697 1299 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms