Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm3822-201ENSMUST00000201941 2935 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Ndrg3-203ENSMUST00000109558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Ttc17-204ENSMUST00000111238 4590 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm16316-201ENSMUST00000154065 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm37829-201ENSMUST00000193864 2213 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Tagap-201ENSMUST00000036370 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Adcy9-202ENSMUST00000117801 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Nup210l-201ENSMUST00000029548 5681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Adgrl3-213ENSMUST00000120292 5026 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm42444-201ENSMUST00000199366 4558 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm42811-201ENSMUST00000201951 2768 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Slco2b1-203ENSMUST00000107088 4369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Tsr2-201ENSMUST00000026295 3804 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Trpa1-201ENSMUST00000041447 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Adra1a-201ENSMUST00000054661 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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