Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm32005-201ENSMUST00000212446 959 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 D330037F02Rik-202ENSMUST00000217400 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm32220-201ENSMUST00000218420 298 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr24-201ENSMUST00000066997 1157 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Mro-201ENSMUST00000119239 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Tex9-201ENSMUST00000085358 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Mbtd1-205ENSMUST00000107853 5245 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rnf19a-201ENSMUST00000022890 4277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm5065-201ENSMUST00000056639 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr1110-202ENSMUST00000152758 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ube2k-205ENSMUST00000201383 1553 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm3455-201ENSMUST00000204812 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Sat2-202ENSMUST00000108656 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm12170-201ENSMUST00000119281 300 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm9050-201ENSMUST00000119501 448 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm5644-201ENSMUST00000122039 465 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm14260-201ENSMUST00000125121 260 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm12496-201ENSMUST00000154377 668 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 4930512B01Rik-202ENSMUST00000188608 983 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm45346-201ENSMUST00000209925 1273 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Pfdn5-202ENSMUST00000062492 464 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Tarm1-201ENSMUST00000065703 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Hdhd2-207ENSMUST00000147332 1705 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Phc3-202ENSMUST00000064718 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 CT025619.2-201ENSMUST00000216975 2312 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 AC099612.1-201ENSMUST00000226318 1636 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Palb2-203ENSMUST00000106468 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm14258-201ENSMUST00000144607 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ube2v1-201ENSMUST00000060645 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rab27a-203ENSMUST00000184146 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm11238-201ENSMUST00000084479 1323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Trim9-203ENSMUST00000167755 4559 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Sp1-202ENSMUST00000163709 3134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 CT025642.3-201ENSMUST00000225503 4086 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Tex11-203ENSMUST00000113718 3278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Sprr2a2-201ENSMUST00000071805 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Ncor1-202ENSMUST00000037575 4246 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr621-ps1-201ENSMUST00000119741 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm14425-201ENSMUST00000121240 606 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Trp53-ps-201ENSMUST00000166597 141 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Clcn1Q64347 Slc35a5-205ENSMUST00000181177 865 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms