Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AtmQ62388 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
AtmQ62388 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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AtmQ62388 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AtmQ62388 AC125020.1-201ENSMUST00000220137 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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AtmQ62388 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AtmQ62388 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AtmQ62388 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AtmQ62388 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
AtmQ62388 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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