Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AC155934.1-201ENSMUST00000213802 322 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Cutal-202ENSMUST00000047447 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pcp4-201ENSMUST00000061739 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Prss35-201ENSMUST00000036426 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Mcm7-201ENSMUST00000000505 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Klrb1b-201ENSMUST00000032472 2228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm42811-201ENSMUST00000201951 2768 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Pygl-202ENSMUST00000161083 2992 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Smok2b-202ENSMUST00000162940 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Igkv3-4-201ENSMUST00000103401 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm12838-201ENSMUST00000116278 325 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Rps29P62274 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms