Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm19196-202ENSMUST00000210709 321 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm19196-203ENSMUST00000211164 363 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC160338.2-201ENSMUST00000215508 281 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Taf1b-203ENSMUST00000222710 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC132247.1-201ENSMUST00000225930 585 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Mylpf-201ENSMUST00000032910 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cd40lg-201ENSMUST00000033466 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Rpl36-ps3-201ENSMUST00000085720 315 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 A130023I24Rik-201ENSMUST00000152709 1897 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Slc12a3-205ENSMUST00000212134 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr1347-202ENSMUST00000207339 1737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cass4-202ENSMUST00000103073 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Eif4b-201ENSMUST00000169681 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Spata17-205ENSMUST00000183819 1552 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr155-202ENSMUST00000107860 3480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Optn-201ENSMUST00000027986 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC122887.1-201ENSMUST00000219265 2722 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Afp-201ENSMUST00000042755 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr554-203ENSMUST00000215995 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm44873-201ENSMUST00000208490 3428 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Egf-209ENSMUST00000199615 3211 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ccnb1-202ENSMUST00000091295 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm4907-201ENSMUST00000116614 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ccdc169-201ENSMUST00000052904 2889 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ccdc36-201ENSMUST00000076592 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Palmd-201ENSMUST00000040097 2433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm22268-201ENSMUST00000104009 131 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm14427-201ENSMUST00000117183 635 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pinlyp-201ENSMUST00000011776 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm8087-201ENSMUST00000119091 567 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr621-ps1-201ENSMUST00000119741 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm12708-202ENSMUST00000136941 1046 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm22587-201ENSMUST00000157511 298 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm23195-201ENSMUST00000158814 129 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm5977-201ENSMUST00000174304 573 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm19402-201ENSMUST00000180297 801 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cysrt1-203ENSMUST00000186719 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pisrt1-201ENSMUST00000195532 515 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm7270-202ENSMUST00000195850 1131 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm45323-201ENSMUST00000209853 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm4178-201ENSMUST00000218307 649 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm46344-201ENSMUST00000220530 887 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC211878.7-201ENSMUST00000222851 661 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Psors1c2-201ENSMUST00000025273 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms