Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Zbtb26-202ENSMUST00000102789 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Phc3-202ENSMUST00000064718 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Khdc1b-201ENSMUST00000147615 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 1810053B23Rik-204ENSMUST00000185971 1309 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm28352-201ENSMUST00000186654 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm28972-201ENSMUST00000186990 2167 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm28866-201ENSMUST00000187298 2167 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm28878-201ENSMUST00000188272 2167 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm28246-201ENSMUST00000188308 2167 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm28823-201ENSMUST00000188540 2167 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm28346-201ENSMUST00000189021 2167 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Them7-201ENSMUST00000068813 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm11220-201ENSMUST00000118844 475 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 n-R5s76-201ENSMUST00000122700 113 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Fam229b-203ENSMUST00000125042 707 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Tle6-213ENSMUST00000151858 627 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm27043-201ENSMUST00000182807 958 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm43782-201ENSMUST00000202790 229 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm35501-202ENSMUST00000215101 459 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 AC142114.1-201ENSMUST00000227724 328 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm17359-203ENSMUST00000199658 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm37675-201ENSMUST00000192303 2847 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gem-201ENSMUST00000029868 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Olfr329-ps-202ENSMUST00000108823 1060 ntAPPRIS P2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm16150-201ENSMUST00000127620 437 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm1322-201ENSMUST00000134620 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Snhg17-202ENSMUST00000138592 342 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm20485-201ENSMUST00000174452 394 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 4833412C05Rik-202ENSMUST00000208257 850 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 AC101831.1-201ENSMUST00000228245 691 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Mfap5-201ENSMUST00000032210 946 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms