Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Zfat-202ENSMUST00000160248 3866 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm43776-201ENSMUST00000199729 2914 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 CT009711.1-201ENSMUST00000223992 3040 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Ugt2a3-201ENSMUST00000031195 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Adgrl3-213ENSMUST00000120292 5026 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm37074-201ENSMUST00000193444 1843 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Smarca1-201ENSMUST00000077569 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 2410089E03Rik-201ENSMUST00000110617 10469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm16407-201ENSMUST00000122134 567 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Ccnb1-202ENSMUST00000091295 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Pcyt1a-201ENSMUST00000079791 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Uhrf1-201ENSMUST00000001258 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Abcc5-204ENSMUST00000115547 5372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Rps6ka1-206ENSMUST00000168974 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Sgsh-201ENSMUST00000005173 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Stat1-212ENSMUST00000191435 2803 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Pygl-202ENSMUST00000161083 2992 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Vmn2r8-201ENSMUST00000172140 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Olfr1219-202ENSMUST00000213724 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm5535-208ENSMUST00000210482 1403 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Slc13a1-201ENSMUST00000031713 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm45062-201ENSMUST00000162564 5842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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