Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Olfr696-ps1-201ENSMUST00000207160 948 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm17909-201ENSMUST00000207587 907 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 AC119987.1-201ENSMUST00000212316 848 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Olfr17-201ENSMUST00000098138 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm28427-201ENSMUST00000190144 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm38072-201ENSMUST00000192127 2162 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm37066-201ENSMUST00000192713 2061 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm12394-201ENSMUST00000107981 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm5535-208ENSMUST00000210482 1403 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Olfr353-201ENSMUST00000100149 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm12883-201ENSMUST00000117867 364 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm12098-201ENSMUST00000118277 508 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm12930-201ENSMUST00000146679 676 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Aamdc-214ENSMUST00000178078 723 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm44764-202ENSMUST00000204912 671 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 AC125543.2-201ENSMUST00000222114 105 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 CT030170.7-201ENSMUST00000223372 103 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gkn2-201ENSMUST00000032128 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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