Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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PtprtQ99M80 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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PtprtQ99M80 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm4849-201ENSMUST00000188428 2246 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Grhl3-201ENSMUST00000105855 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprtQ99M80 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprtQ99M80 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprtQ99M80 Gja1-206ENSMUST00000220069 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gtf2a1-201ENSMUST00000021345 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Igkv12-89-201ENSMUST00000103335 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprtQ99M80 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 AC123069.1-201ENSMUST00000215094 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprtQ99M80 Pax9-203ENSMUST00000153250 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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PtprtQ99M80 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm28457-202ENSMUST00000191277 1498 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm37654-201ENSMUST00000193019 1498 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Ctcflos-204ENSMUST00000153523 3476 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Pnma2-202ENSMUST00000122431 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Foxp3-202ENSMUST00000115738 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Tmem63c-202ENSMUST00000131878 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprtQ99M80 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms