Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp47Q8BY87 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Usp47Q8BY87 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Usp47Q8BY87 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp47Q8BY87 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Usp47Q8BY87 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Usp47Q8BY87 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Usp47Q8BY87 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Usp47Q8BY87 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp47Q8BY87 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp47Q8BY87 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp47Q8BY87 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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