Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Olfr1350-202ENSMUST00000207221 1521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Lrrc49-203ENSMUST00000114032 2586 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Cass4-202ENSMUST00000103073 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 AC125020.1-201ENSMUST00000220137 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Eya3-202ENSMUST00000079157 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm10600-201ENSMUST00000117202 2047 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Nsun3-201ENSMUST00000063089 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Sez6l2-202ENSMUST00000106333 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm45062-201ENSMUST00000162564 5842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Mkl1-201ENSMUST00000109579 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Sez6-201ENSMUST00000000646 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Ebf2-201ENSMUST00000022637 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Faf2-203ENSMUST00000126071 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Usp54Q8BL06 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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