Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm20918-201ENSMUST00000179629 684 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 6530411M01Rik-201ENSMUST00000181618 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm7191-201ENSMUST00000182678 990 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Gm28508-201ENSMUST00000188016 696 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Olfr17-201ENSMUST00000098138 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm37821-201ENSMUST00000195476 1843 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Gm15834-201ENSMUST00000129740 2097 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
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Sh3bp1P55194 1700022H16Rik-201ENSMUST00000188935 476 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm5256-201ENSMUST00000191412 877 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Sh3bp1P55194 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
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