Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Chn2-211ENSMUST00000203941 687 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Chn2-214ENSMUST00000204746 825 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Chn2-215ENSMUST00000204921 861 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm45227-201ENSMUST00000205585 169 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 BC060293-201ENSMUST00000207005 1104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm2788-205ENSMUST00000209849 933 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm45566-201ENSMUST00000209883 1168 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm17910-201ENSMUST00000211038 838 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm7546-202ENSMUST00000211354 275 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm7965-201ENSMUST00000211675 1105 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC153968.1-201ENSMUST00000215584 334 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC161117.2-201ENSMUST00000221908 451 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC156576.1-201ENSMUST00000222315 500 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC124173.1-201ENSMUST00000223701 189 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC140406.2-201ENSMUST00000227539 481 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Spats1-201ENSMUST00000024731 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Glt8d2-202ENSMUST00000065815 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm26003-201ENSMUST00000083061 113 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr45-201ENSMUST00000084454 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Defa29-201ENSMUST00000098890 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1239-201ENSMUST00000099780 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1222-201ENSMUST00000099794 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm43154-206ENSMUST00000209562 1884 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm38130-201ENSMUST00000194311 1761 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tbata-204ENSMUST00000122261 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm38095-201ENSMUST00000192896 1402 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm5533-201ENSMUST00000070987 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Sag-209ENSMUST00000177757 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Cinp-202ENSMUST00000220607 1579 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm9030-201ENSMUST00000218405 2410 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Slc31a1-201ENSMUST00000084526 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Proz-201ENSMUST00000033822 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Stmn1-202ENSMUST00000105867 802 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gngt2-204ENSMUST00000107709 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Ccdc141-203ENSMUST00000111833 631 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Zfp637-204ENSMUST00000112861 1202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm14278-201ENSMUST00000117381 878 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm14839-201ENSMUST00000117983 714 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm11635-202ENSMUST00000139424 472 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb1P13372 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms