Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Muc13-202ENSMUST00000115044 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm12142-201ENSMUST00000117114 485 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm3239-202ENSMUST00000169675 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm5981-201ENSMUST00000199912 487 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC165254.1-203ENSMUST00000222925 574 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC154227.2-201ENSMUST00000228677 2101 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr1388-201ENSMUST00000055584 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AW822252-205ENSMUST00000192662 1352 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Klhl41-201ENSMUST00000100050 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm10744-201ENSMUST00000220184 2706 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm20507-201ENSMUST00000163245 2860 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC122346.1-202ENSMUST00000225586 2116 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm45292-201ENSMUST00000211232 2207 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gbp9-202ENSMUST00000100961 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Slc7a2-202ENSMUST00000098816 3677 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Rcbtb2-218ENSMUST00000169479 3351 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Anapc1-203ENSMUST00000110333 4214 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Dnajc28-204ENSMUST00000169982 3535 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr545-202ENSMUST00000216116 3496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm32569-201ENSMUST00000193955 604 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr24-201ENSMUST00000066997 1157 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Olfr555-201ENSMUST00000098220 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gucy1b3-204ENSMUST00000193597 3171 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
ScaperF8VQ70 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Dhcr7-207ENSMUST00000141916 2752 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Klrb1b-201ENSMUST00000032472 2228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Ciao1-201ENSMUST00000003759 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Aldh3b3-202ENSMUST00000179433 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm28813-201ENSMUST00000186293 1497 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Gm29324-202ENSMUST00000188242 1497 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ScaperF8VQ70 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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