Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm20745-201ENSMUST00000216827 3796 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Pcdhga1-202ENSMUST00000194888 3247 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Unc45b-202ENSMUST00000108160 4152 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Oat-201ENSMUST00000084500 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 AC164978.1-201ENSMUST00000228608 4011 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Trim39-205ENSMUST00000173369 2914 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm38110-201ENSMUST00000194594 1551 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Rufy3-207ENSMUST00000199312 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Aqp9-203ENSMUST00000113570 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Rpl22-201ENSMUST00000103191 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Pinlyp-201ENSMUST00000011776 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm11765-201ENSMUST00000121173 1205 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm17138-201ENSMUST00000165702 459 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm23413-201ENSMUST00000175521 125 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 2610016A17Rik-203ENSMUST00000188711 515 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm28401-202ENSMUST00000190769 550 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm43310-201ENSMUST00000198975 820 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm18402-201ENSMUST00000203834 586 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Rps3-205ENSMUST00000208532 489 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 AC119987.1-201ENSMUST00000212316 848 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Rab3b-201ENSMUST00000003502 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Olfr298-201ENSMUST00000077800 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm15283-201ENSMUST00000125308 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Pramef6-201ENSMUST00000081645 1487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Gm5535-208ENSMUST00000210482 1403 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Prrt4B2RU40 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms