Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Phc3-203ENSMUST00000099163 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm20539-201ENSMUST00000174811 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm15938-201ENSMUST00000150079 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm26070-201ENSMUST00000157500 137 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Mocs2-212ENSMUST00000184214 551 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 AC142114.1-201ENSMUST00000227724 328 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Chmp4bQ9D8B3 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Aktip-204ENSMUST00000120426 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Brdt-202ENSMUST00000112677 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Rpl22-201ENSMUST00000103191 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 B430319H21Rik-201ENSMUST00000123420 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm14487-201ENSMUST00000145413 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm29471-201ENSMUST00000190527 700 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm30270-201ENSMUST00000202675 524 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Slc13a2os-201ENSMUST00000149865 3627 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ensa-201ENSMUST00000037983 3845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Chmp4bQ9D8B3 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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