Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Dclk1-212ENSMUST00000199585 5196 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Vmn2r30-201ENSMUST00000072475 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm17821-201ENSMUST00000223448 1693 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm38249-201ENSMUST00000192560 2321 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Hrh1-204ENSMUST00000161220 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm13750-201ENSMUST00000117621 465 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm8540-201ENSMUST00000168952 732 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm45515-201ENSMUST00000210796 2141 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Usp3-202ENSMUST00000098613 2797 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Lipc-201ENSMUST00000034731 1920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm37949-201ENSMUST00000192808 2091 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Fmr1os-201ENSMUST00000181533 2743 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Rps6ka1-206ENSMUST00000168974 2982 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 AC120163.1-201ENSMUST00000228618 1680 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Grk1-202ENSMUST00000209909 7431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Grk1-201ENSMUST00000033827 7425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm11870-201ENSMUST00000119255 1322 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Pcm1-201ENSMUST00000045218 6624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Mro-201ENSMUST00000119239 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Olfr449-201ENSMUST00000050729 1037 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 AC163342.1-201ENSMUST00000216533 2718 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Fhl1-205ENSMUST00000114773 2298 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Fgg-201ENSMUST00000048486 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Pkp2Q9CQ73 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms