Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Fam19a1-201ENSMUST00000075080 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm25501-201ENSMUST00000104429 132 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm15572-201ENSMUST00000119248 593 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 BC021767-202ENSMUST00000136988 905 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm28444-201ENSMUST00000190777 2137 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 AC142407.1-201ENSMUST00000214371 494 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 AC155644.1-201ENSMUST00000218527 890 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 AC154747.2-201ENSMUST00000225109 780 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Olfr304-201ENSMUST00000077210 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm15433-201ENSMUST00000097671 891 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Spef2-205ENSMUST00000162780 1639 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Eif4a2-202ENSMUST00000077605 2708 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Ercc8Q8CFD5 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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Ercc8Q8CFD5 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 1700015F17Rik-201ENSMUST00000115447 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm17197-201ENSMUST00000163160 452 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ercc8Q8CFD5 Clpsl2-201ENSMUST00000025061 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
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