Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Gm44627-201ENSMUST00000206739 1531 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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AtmQ62388 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Lemd1-205ENSMUST00000188169 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Gigyf2-205ENSMUST00000172794 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AtmQ62388 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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AtmQ62388 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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AtmQ62388 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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AtmQ62388 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
AtmQ62388 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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