Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm14425-201ENSMUST00000121240 606 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 n-R5s76-201ENSMUST00000122700 113 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 H2-Aa-204ENSMUST00000174751 826 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Gm28723-201ENSMUST00000188640 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm28401-202ENSMUST00000190769 550 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Sycp3-201ENSMUST00000020252 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm45554-201ENSMUST00000210731 1004 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Cldn34b1-201ENSMUST00000096852 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Cth-201ENSMUST00000118539 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm6468-201ENSMUST00000201076 1443 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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Sh3bp1P55194 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm14668-201ENSMUST00000118588 1724 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Sh3bp1P55194 Gm11621-201ENSMUST00000118253 589 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
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