Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 4930442J19Rik-202ENSMUST00000157058 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc18-201ENSMUST00000038956 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Olfr608-201ENSMUST00000213546 1482 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm37258-201ENSMUST00000191734 1627 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm22760-201ENSMUST00000102277 93 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Mup-ps24-201ENSMUST00000119939 286 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 A630023P12Rik-201ENSMUST00000129007 1221 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Dxo-208ENSMUST00000174092 738 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm23403-201ENSMUST00000179169 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 1190005I06Rik-203ENSMUST00000180677 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Olfr503-202ENSMUST00000211693 966 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm3011-201ENSMUST00000215669 582 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm8171-201ENSMUST00000217443 720 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm8689-201ENSMUST00000218709 712 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 AC124736.1-201ENSMUST00000226382 419 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Retnlb-201ENSMUST00000023328 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Trap1a-201ENSMUST00000054534 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Tarm1-201ENSMUST00000065703 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Rpl21-ps3-201ENSMUST00000080223 483 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Snora65-201ENSMUST00000083190 130 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Cldn34c3J3QJW5 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Msr1-201ENSMUST00000026021 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 4921515L22Rik-201ENSMUST00000218993 1537 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm29671-201ENSMUST00000189438 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Cldn34c3J3QJW5 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms