Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Egflam-201ENSMUST00000058593 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Dlk1-208ENSMUST00000173539 3914 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Fam212b-201ENSMUST00000066610 4701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Tvp23a-201ENSMUST00000051118 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 AC122360.1-201ENSMUST00000217737 624 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Tmem175-202ENSMUST00000078323 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Lrrc18-201ENSMUST00000038956 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Plcd4-202ENSMUST00000067916 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm7982-201ENSMUST00000101011 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm6351-201ENSMUST00000101021 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm7682-201ENSMUST00000098289 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Eya3-202ENSMUST00000079157 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm45903-201ENSMUST00000212891 2898 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Arhgef9-210ENSMUST00000182001 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
OtofQ9ESF1 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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