Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Trub1-202ENSMUST00000026073 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 4930555G01Rik-201ENSMUST00000112770 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm3099-201ENSMUST00000112787 2065 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm21560-201ENSMUST00000168480 2066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC160562.1-201ENSMUST00000216170 3468 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Epn2-201ENSMUST00000001063 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm37074-201ENSMUST00000193444 1843 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Wdr48-208ENSMUST00000217472 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Lrrc1-201ENSMUST00000113421 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Man2b1-201ENSMUST00000034121 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Zfp800-201ENSMUST00000035930 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Tmem175-202ENSMUST00000078323 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Slc7a2-202ENSMUST00000098816 3677 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Paqr5-202ENSMUST00000113990 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 U2af1l4-204ENSMUST00000163464 651 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm26748-201ENSMUST00000180406 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm8407-201ENSMUST00000192719 427 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 9930024M15Rik-201ENSMUST00000214902 2584 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm43890-201ENSMUST00000203437 2799 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Wdr76-202ENSMUST00000099473 2315 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Tmem63c-201ENSMUST00000110187 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm15721-201ENSMUST00000138406 3308 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Pcdhb8-201ENSMUST00000051163 3334 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Lage3-203ENSMUST00000114153 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr958-202ENSMUST00000215505 3514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Tmem268-202ENSMUST00000080336 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Camk2a-201ENSMUST00000025519 3244 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Rnf222-201ENSMUST00000065213 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 1600012P17Rik-201ENSMUST00000062159 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Kxd1-203ENSMUST00000118850 992 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Serpina4-ps1-201ENSMUST00000166601 1287 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr984-201ENSMUST00000056795 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm42847-201ENSMUST00000201732 2553 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Arsg-203ENSMUST00000106697 3232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 AC163342.1-201ENSMUST00000216533 2718 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm44834-201ENSMUST00000206671 1396 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Runx1t1-202ENSMUST00000098256 3317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Vsnl1-202ENSMUST00000220506 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 B130021K23Rik-201ENSMUST00000205226 2593 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Aqp9-203ENSMUST00000113570 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atg3Q9CPX6 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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