Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp54Q8BL06 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp54Q8BL06 Gm21560-201ENSMUST00000168480 2066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp54Q8BL06 Proz-201ENSMUST00000033822 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp54Q8BL06 Entpd5-205ENSMUST00000120942 4881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp54Q8BL06 4932413F04Rik-201ENSMUST00000190332 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp54Q8BL06 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp54Q8BL06 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp54Q8BL06 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp54Q8BL06 Gm2447-202ENSMUST00000193813 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp54Q8BL06 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Ttc21a-201ENSMUST00000035100 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm17130-201ENSMUST00000201542 2683 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Trim9-203ENSMUST00000167755 4559 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Snhg7os-202ENSMUST00000131841 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm43776-201ENSMUST00000199729 2914 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Olfr545-202ENSMUST00000216116 3496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Cc2d2a-201ENSMUST00000048150 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Cfap43-205ENSMUST00000160247 5264 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Rpgr-203ENSMUST00000073392 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Pygl-202ENSMUST00000161083 2992 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Ghitm-202ENSMUST00000165649 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Atxn7l1-210ENSMUST00000144586 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Rbm25-201ENSMUST00000048155 4226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 4930543E12Rik-202ENSMUST00000210408 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Sept2-213ENSMUST00000168776 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Vegfd-201ENSMUST00000033751 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm16121-201ENSMUST00000128520 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Ston1-207ENSMUST00000163588 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Arsg-203ENSMUST00000106697 3232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm44802-201ENSMUST00000208026 1916 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Zfp90-205ENSMUST00000212874 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Rpl31-ps25-201ENSMUST00000181557 379 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gucy1b3-204ENSMUST00000193597 3171 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Usp54Q8BL06 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms