Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm5560-201ENSMUST00000086918 892 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Dnajc28-204ENSMUST00000169982 3535 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Muc13-202ENSMUST00000115044 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Uros-201ENSMUST00000033276 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm21188-203ENSMUST00000224713 1669 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm44792-201ENSMUST00000207008 1628 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Usp17lb-202ENSMUST00000106814 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Serpina12-201ENSMUST00000043915 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Dnaic1-201ENSMUST00000102963 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Olfr554-203ENSMUST00000215995 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm33543-202ENSMUST00000210336 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Mterf4-201ENSMUST00000027492 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 AC115891.2-201ENSMUST00000218448 1341 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm27509-201ENSMUST00000102400 79 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm14419-201ENSMUST00000108975 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm12038-201ENSMUST00000117322 207 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm12250-201ENSMUST00000119467 1274 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm25844-201ENSMUST00000122587 309 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 4930579M01Rik-201ENSMUST00000130943 933 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm11300-201ENSMUST00000137651 565 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 E330017L17Rik-202ENSMUST00000139190 861 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm16556-201ENSMUST00000162608 471 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm8964-201ENSMUST00000165944 805 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Vmn2r-ps87-201ENSMUST00000174393 876 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm933-201ENSMUST00000179384 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm5262-201ENSMUST00000180655 996 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm27199-201ENSMUST00000185026 623 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm9120-201ENSMUST00000190835 994 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Chn2-211ENSMUST00000203941 687 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Chn2-214ENSMUST00000204746 825 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Chn2-215ENSMUST00000204921 861 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Rpl18a-ps4-201ENSMUST00000206176 536 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 D830044I16Rik-205ENSMUST00000206296 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Vmn2r-ps88-201ENSMUST00000209168 804 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm7836-201ENSMUST00000209730 432 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Msra-204ENSMUST00000210363 1042 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm34099-201ENSMUST00000211592 704 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 AC153508.1-201ENSMUST00000218849 967 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm36550-201ENSMUST00000221947 416 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 AC139381.1-201ENSMUST00000224215 478 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 AC112157.1-201ENSMUST00000226016 543 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 AC116596.2-201ENSMUST00000226642 526 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 AC140799.1-201ENSMUST00000228866 787 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 AC122821.1-201ENSMUST00000228934 705 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 AC154283.2-201ENSMUST00000228954 614 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Olfr452-201ENSMUST00000075468 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Rpl21-ps3-201ENSMUST00000080223 483 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm5442-201ENSMUST00000202121 2034 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Olfr467-202ENSMUST00000208563 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rpl13aP19253 Gm8366-201ENSMUST00000118751 1769 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms