Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm45227-201ENSMUST00000205585 169 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ceacam10-203ENSMUST00000206847 662 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm45346-201ENSMUST00000209925 1273 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Rps7-ps1-201ENSMUST00000211928 391 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC124577.1-201ENSMUST00000214044 487 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm10054-201ENSMUST00000223362 431 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Tssk4-203ENSMUST00000226497 1235 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ucn2-201ENSMUST00000052724 1155 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 5330417H12Rik-201ENSMUST00000060348 1191 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ms4a10-201ENSMUST00000072748 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm24826-201ENSMUST00000083695 215 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Tlr5-201ENSMUST00000110997 3199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Zfp949-203ENSMUST00000161458 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm15931-201ENSMUST00000118066 1852 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Spin2c-201ENSMUST00000049999 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Nip7-201ENSMUST00000034392 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cyfip1-203ENSMUST00000163845 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm8159-202ENSMUST00000170546 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Vmn2r30-201ENSMUST00000072475 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Calcr-201ENSMUST00000075644 3763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 4930511A02Rik-201ENSMUST00000181268 1935 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm26521-201ENSMUST00000181576 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm7328-201ENSMUST00000211123 2225 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Dnaic1-201ENSMUST00000102963 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Psg19-203ENSMUST00000182853 1518 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Oca2-201ENSMUST00000032633 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ufm1-203ENSMUST00000146598 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Myo19-201ENSMUST00000020837 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Pkia-201ENSMUST00000028999 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm25608-201ENSMUST00000104021 132 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Asic5-202ENSMUST00000107736 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm14410-201ENSMUST00000108964 912 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm23840-201ENSMUST00000116950 97 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Atp5k-202ENSMUST00000118632 272 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm12206-201ENSMUST00000119795 601 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Mettl8-205ENSMUST00000121586 1151 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm14609-201ENSMUST00000122176 902 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Fam229b-204ENSMUST00000134279 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Fam229b-207ENSMUST00000137132 663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm15879-201ENSMUST00000139334 809 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Itih5l-ps-202ENSMUST00000148862 808 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Glipr1l2-202ENSMUST00000148897 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm17195-201ENSMUST00000170289 428 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm25190-201ENSMUST00000176664 95 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 0610031O16Rik-203ENSMUST00000185046 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Scgb1b12-201ENSMUST00000188355 417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm29441-201ENSMUST00000191584 211 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm37506-201ENSMUST00000192008 143 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm35106-201ENSMUST00000192731 250 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Vpreb2P13373 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms